我的名字是Bones,Masterhouse NPC。现在,我最近学会了使用KEGG分析信号路径。真的很美。莫震:你真的认识KEGG吗?
骨头:一般来说,我基本上都是用它。
莫震:是这样吗?
你知道KO是什么吗?
Bone:是的,我知道这一点,最近很流行:然后是KO。
莫震:嘿......不是太极拳吗?可以吗?让我们从KEGG开始吧。KEGG拥有许多数据库,包括基因数据库和信号路径数据库等分级分类数据库。例如,搜索TP53将为您提供结果:在红色框中有一个分层数据库KEGG,其中包含所有基因的功能注释和信号路径注释。该分析有点类似于GO分析,根据各种功能和信号路径分类,然后用KO.Tag(KEGGOntology)标记。
蓝盒子是蛋白质或酶KEGG分类系统。它们在序列上非常相似,并且在相同途径中具有相似功能的蛋白质被分组并用KO标记(KEGG Orthologs)。
因此,KEGG的两个KO标记实际上是不同的,并且本体层次结构(KEGGOntology)标有小写的“ko”。
KEGG ortholog,缩写为K.
例如,当您打开P53 KEGGgene数据库时,其层次结构分类号将显示在信号路径中。
因此,问题是要知道KEGG对应物的用途。
在这里使用它。例如,如果打开KEGG信号路线图,您将看到有相应的按钮。当点击时,该信号通路中的所有基因包括KEGG同源物:来自不同物种的同源基因,或参与该信号传导途径的相同物种的基因,其序列相似。
可以通过蛋白质序列比对来分析所有物种信号途径。
换句话说,只要你有一个蛋白质序列,你可以猜出这个特定的功能是什么,无论哪个物种。
当然,这也是一种工具。例如,您可以使用此KAAS对特定蛋白质序列进行KO分析。当然你需要输入蛋白质序列和邮箱号码:收到结果电子邮件。即使有10分钟,也有一个带有序列示例的bian:点打开后你可以看到评论KO从这个序列中越来越多:......美丽的分离线...... Lee Morzen博士:你认为KEGG有点搞笑吗?

是的,我们今天就去。